Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
ZNF316A6NFI3 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNF316A6NFI3 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms