Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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BRPF3Q9ULD4 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BRPF3Q9ULD4 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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