Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FOXQ1Q9C009 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXQ1Q9C009 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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