Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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USP53Q70EK8 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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USP53Q70EK8 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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USP53Q70EK8 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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USP53Q70EK8 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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USP53Q70EK8 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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USP53Q70EK8 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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