Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BBS9Q3SYG4 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.6 ms