Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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GEN1Q17RS7 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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GEN1Q17RS7 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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GEN1Q17RS7 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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GEN1Q17RS7 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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