Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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CCDC142Q17RM4 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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CCDC142Q17RM4 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
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CCDC142Q17RM4 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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CCDC142Q17RM4 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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