Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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HIF1AQ16665 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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HIF1AQ16665 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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HIF1AQ16665 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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HIF1AQ16665 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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HIF1AQ16665 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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HIF1AQ16665 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HIF1AQ16665 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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