Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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SGCAQ16586 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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SGCAQ16586 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
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SGCAQ16586 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
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SGCAQ16586 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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SGCAQ16586 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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SGCAQ16586 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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SGCAQ16586 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
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