Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
GABRA6Q16445 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GABRA6Q16445 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GABRA6Q16445 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GABRA6Q16445 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GABRA6Q16445 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GABRA6Q16445 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
GABRA6Q16445 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GABRA6Q16445 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GABRA6Q16445 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GABRA6Q16445 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GABRA6Q16445 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GABRA6Q16445 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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GABRA6Q16445 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GABRA6Q16445 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GABRA6Q16445 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GABRA6Q16445 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GABRA6Q16445 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GABRA6Q16445 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GABRA6Q16445 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GABRA6Q16445 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GABRA6Q16445 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GABRA6Q16445 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
GABRA6Q16445 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GABRA6Q16445 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GABRA6Q16445 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GABRA6Q16445 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GABRA6Q16445 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GABRA6Q16445 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GABRA6Q16445 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GABRA6Q16445 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GABRA6Q16445 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GABRA6Q16445 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
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