Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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LAMA4Q16363 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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LAMA4Q16363 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA4Q16363 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
LAMA4Q16363 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
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