Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms