Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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