Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NEDD8Q15843 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms