Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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