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| BRD3 | Q15059 | IQCG-205 | ENST00000455191 | 1981 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC00630-205 | ENST00000440496 | 2101 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
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| BRD3 | Q15059 | RNU1-14P-201 | ENST00000362759 | 152 nt | BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
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| BRD3 | Q15059 | TAB3-AS1-201 | ENST00000428263 | 245 nt | TSL 5 BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC004160.1-205 | ENST00000428967 | 577 nt | TSL 4 BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC092573.2-201 | ENST00000434546 | 243 nt | BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC022537.1-201 | ENST00000435271 | 446 nt | TSL 3 BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
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| BRD3 | Q15059 | TAF9P1-201 | ENST00000445421 | 515 nt | BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
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| BRD3 | Q15059 | TAF9P2-201 | ENST00000454958 | 515 nt | BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC041039.1-201 | ENST00000485656 | 536 nt | BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC087341.1-201 | ENST00000521490 | 491 nt | TSL 2 BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC007115.1-201 | ENST00000546853 | 234 nt | BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC007342.4-202 | ENST00000565189 | 721 nt | TSL 3 BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR3118-1-201 | ENST00000581787 | 76 nt | BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC097717.1-249 | ENST00000608040 | 401 nt | TSL 5 BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC239868.4-201 | ENST00000608318 | 671 nt | BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
| BRD3 | Q15059 | BX664608.1-201 | ENST00000610519 | 487 nt | BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR378J-201 | ENST00000611988 | 109 nt | BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
| BRD3 | Q15059 | MALAT1-210 | ENST00000617489 | 318 nt | TSL 2 BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR6076-201 | ENST00000617521 | 113 nt | BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC00923-207 | ENST00000619015 | 505 nt | TSL 5 BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
| BRD3 | Q15059 | CD44-239 | ENST00000639002 | 528 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC091152.2-201 | ENST00000591628 | 2569 nt | BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
| BRD3 | Q15059 | ABCD2-201 | ENST00000308666 | 6238 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC116667.1-201 | ENST00000604855 | 2072 nt | BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
| BRD3 | Q15059 | FOXP2-224 | ENST00000635534 | 4290 nt | TSL 5 BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
| BRD3 | Q15059 | NDST4-201 | ENST00000264363 | 3351 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.17 | □□□□□ -1.74 | | |
| BRD3 | Q15059 | IL6ST-205 | ENST00000381294 | 2574 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.17 | □□□□□ -1.74 | | |
| BRD3 | Q15059 | ELAVL2-204 | ENST00000397312 | 3805 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.17 | □□□□□ -1.74 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC00648-202 | ENST00000555985 | 2885 nt | TSL 2 BASIC | 4.17 | □□□□□ -1.74 | | |
| BRD3 | Q15059 | IDE-202 | ENST00000371581 | 4480 nt | TSL 2 BASIC | 4.17 | □□□□□ -1.74 | | |
| BRD3 | Q15059 | GABRA1-220 | ENST00000638159 | 4088 nt | TSL 5 BASIC | 4.17 | □□□□□ -1.74 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR10J1-203 | ENST00000642080 | 3503 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.17 | □□□□□ -1.74 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR52E2-201 | ENST00000321522 | 978 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.17 | □□□□□ -1.74 | | |
| BRD3 | Q15059 | FGF7P2-201 | ENST00000332473 | 296 nt | BASIC | 4.17 | □□□□□ -1.74 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNORD35B-201 | ENST00000363660 | 87 nt | BASIC | 4.17 | □□□□□ -1.74 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNY3P13-201 | ENST00000365542 | 102 nt | BASIC | 4.17 | □□□□□ -1.74 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AL121872.1-202 | ENST00000435867 | 308 nt | TSL 5 BASIC | 4.17 | □□□□□ -1.74 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPL23AP46-201 | ENST00000438548 | 490 nt | BASIC | 4.17 | □□□□□ -1.74 | | |
| BRD3 | Q15059 | HMGB1P37-201 | ENST00000439613 | 609 nt | BASIC | 4.17 | □□□□□ -1.74 | | |