Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms