Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms