Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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CHD4Q14839 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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CHD4Q14839 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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CHD4Q14839 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
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CHD4Q14839 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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