Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms