Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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