Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF235Q14590 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms