Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
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UBE4AQ14139 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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UBE4AQ14139 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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UBE4AQ14139 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
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UBE4AQ14139 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
UBE4AQ14139 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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