Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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