Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CNGB1Q14028 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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