Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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PDE6HQ13956 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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PDE6HQ13956 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
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PDE6HQ13956 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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PDE6HQ13956 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
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PDE6HQ13956 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
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PDE6HQ13956 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
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PDE6HQ13956 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
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PDE6HQ13956 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
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PDE6HQ13956 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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PDE6HQ13956 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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