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| RUNX3 | Q13761 | UBE2W-203 | ENST00000517608 | 8426 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MT-ND3-201 | ENST00000361227 | 346 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SPRR2D-203 | ENST00000368757 | 800 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA70E-201 | ENST00000384492 | 135 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPA3-203 | ENST00000401447 | 414 nt | TSL 3 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C1D-204 | ENST00000410067 | 736 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007390.1-201 | ENST00000415722 | 356 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | SETP8-201 | ENST00000435341 | 628 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR5H14-201 | ENST00000437310 | 1080 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | MIR663AHG-231 | ENST00000609044 | 590 nt | TSL 5 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC245297.2-201 | ENST00000610119 | 565 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL591516.1-201 | ENST00000611326 | 274 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092628.2-201 | ENST00000622492 | 339 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SATB1-AS1-226 | ENST00000625515 | 776 nt | TSL 5 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC073476.4-201 | ENST00000628409 | 72 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FBXL13-204 | ENST00000436908 | 2577 nt | TSL 5 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MFF-206 | ENST00000392059 | 1710 nt | TSL 5 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SPAM1-205 | ENST00000439500 | 2220 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EFR3A-202 | ENST00000519656 | 5247 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TLR6-205 | ENST00000610323 | 1443 nt | TSL 5 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NUP35-203 | ENST00000409798 | 1470 nt | TSL 2 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL390862.1-201 | ENST00000635467 | 1469 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EVI2A-202 | ENST00000461237 | 1540 nt | APPRIS ALT2 TSL 4 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | STAU2-201 | ENST00000355780 | 4061 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CPB2-202 | ENST00000439329 | 1655 nt | TSL 5 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC30A6-202 | ENST00000357055 | 4758 nt | TSL 2 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA4.1-201 | ENST00000364263 | 144 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CUBN-201 | ENST00000377823 | 705 nt | TSL 3 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL139281.1-201 | ENST00000422120 | 335 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL049610.1-201 | ENST00000423374 | 372 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL365203.2-201 | ENST00000423444 | 196 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR51AB1P-201 | ENST00000429046 | 620 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL683807.1-202 | ENST00000432272 | 382 nt | TSL 2 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | REG1CP-203 | ENST00000434852 | 460 nt | TSL 4 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL138799.3-201 | ENST00000438968 | 350 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | PABPC1P3-201 | ENST00000469174 | 459 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND3P7-201 | ENST00000474435 | 343 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC126121.2-201 | ENST00000486137 | 698 nt | TSL 3 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02213-202 | ENST00000506021 | 774 nt | TSL 2 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008243.1-202 | ENST00000506527 | 481 nt | TSL 5 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SUB1-211 | ENST00000512913 | 684 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-583P-201 | ENST00000516012 | 92 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU2-58P-201 | ENST00000516403 | 183 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-232P-201 | ENST00000517144 | 64 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC011377.1-201 | ENST00000517708 | 275 nt | TSL 3 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IGHVII-62-1-201 | ENST00000519283 | 235 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC104316.1-201 | ENST00000521258 | 625 nt | TSL 3 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR5AK1P-201 | ENST00000524837 | 922 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HIGD1AP10-201 | ENST00000527837 | 282 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC087276.1-201 | ENST00000529659 | 480 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007686.2-201 | ENST00000554043 | 469 nt | TSL 2 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL512347.1-201 | ENST00000566420 | 503 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC002400.1-201 | ENST00000569310 | 726 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR3186-201 | ENST00000577404 | 85 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004223.2-201 | ENST00000590309 | 544 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC011518.1-202 | ENST00000592668 | 407 nt | TSL 5 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Z99497.2-201 | ENST00000603634 | 310 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007566.2-201 | ENST00000603642 | 413 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC112250.2-201 | ENST00000609450 | 491 nt | TSL 3 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | VIS1.1-201 | ENST00000610517 | 203 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL603755.1-201 | ENST00000619504 | 163 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR4496-201 | ENST00000635896 | 61 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC138649.5-201 | ENST00000637456 | 137 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC011139.1-202 | ENST00000637744 | 563 nt | TSL 5 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TMPRSS11A-202 | ENST00000508048 | 3247 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF37BP-203 | ENST00000452306 | 1352 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | POLK-204 | ENST00000504026 | 1484 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009487.2-201 | ENST00000420969 | 6821 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NUP35-201 | ENST00000295119 | 1633 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |