Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RUNX3Q13761 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms