Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BFSP2Q13515 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
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