Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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TCIRG1Q13488 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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TCIRG1Q13488 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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TCIRG1Q13488 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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TCIRG1Q13488 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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TCIRG1Q13488 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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TCIRG1Q13488 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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TCIRG1Q13488 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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TCIRG1Q13488 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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TCIRG1Q13488 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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TCIRG1Q13488 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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TCIRG1Q13488 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TCIRG1Q13488 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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