Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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FOXE3Q13461 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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FOXE3Q13461 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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FOXE3Q13461 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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FOXE3Q13461 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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FOXE3Q13461 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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FOXE3Q13461 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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FOXE3Q13461 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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FOXE3Q13461 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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FOXE3Q13461 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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