Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NME3Q13232 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NME3Q13232 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NME3Q13232 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.8 ms