Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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CBX3Q13185 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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CBX3Q13185 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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CBX3Q13185 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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CBX3Q13185 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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CBX3Q13185 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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CBX3Q13185 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
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CBX3Q13185 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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