Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN3Q13064 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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