Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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