Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KCNMA1Q12791 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms