Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRGP23470 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRGP23470 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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