Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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PTPRBP23467 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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PTPRBP23467 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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PTPRBP23467 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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PTPRBP23467 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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PTPRBP23467 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRBP23467 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
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PTPRBP23467 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
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PTPRBP23467 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
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PTPRBP23467 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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