Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
B4DXG7 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
B4DXG7 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
B4DXG7 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
B4DXG7 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
B4DXG7 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
B4DXG7 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
B4DXG7 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
B4DXG7 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
B4DXG7 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
B4DXG7 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
B4DXG7 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
B4DXG7 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
B4DXG7 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
B4DXG7 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
B4DXG7 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
B4DXG7 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
B4DXG7 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
B4DXG7 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
B4DXG7 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
B4DXG7 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
B4DXG7 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
B4DXG7 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
B4DXG7 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
B4DXG7 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
B4DXG7 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
B4DXG7 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
B4DXG7 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
B4DXG7 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
B4DXG7 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
B4DXG7 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms