Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SOBPA7XYQ1 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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