Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms