Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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USP18Q9UMW8 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP18Q9UMW8 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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USP18Q9UMW8 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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USP18Q9UMW8 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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