Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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USP35Q9P2H5 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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USP35Q9P2H5 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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USP35Q9P2H5 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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USP35Q9P2H5 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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USP35Q9P2H5 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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