Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM53CQ9NYF3 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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