Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1Q9NPL8 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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