Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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SNX29Q8TEQ0 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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SNX29Q8TEQ0 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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SNX29Q8TEQ0 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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SNX29Q8TEQ0 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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SNX29Q8TEQ0 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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SNX29Q8TEQ0 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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SNX29Q8TEQ0 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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SNX29Q8TEQ0 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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SNX29Q8TEQ0 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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SNX29Q8TEQ0 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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