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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC092442.1-201 | ENST00000636216 | 138 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AL356473.1-201 | ENST00000406203 | 1408 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | ZNF639-206 | ENST00000484866 | 1730 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | OR9K2-202 | ENST00000641329 | 3120 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC138915.1-201 | ENST00000565427 | 1685 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | CNOT6L-201 | ENST00000504123 | 8843 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | KIAA1841-202 | ENST00000356719 | 2149 nt | TSL 5 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AGTR1-204 | ENST00000418473 | 2071 nt | TSL 5 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC005539.1-201 | ENST00000443768 | 1479 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | SYTL2-203 | ENST00000359152 | 4123 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | KERA-201 | ENST00000266719 | 2162 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC005832.2-201 | ENST00000538921 | 1430 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | OR5I1-201 | ENST00000301532 | 945 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | CoTC_ribozyme.1-201 | ENST00000408104 | 192 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RN7SKP284-201 | ENST00000411002 | 343 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RPL23AP82-202 | ENST00000427528 | 469 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | TCF7L1-IT1-201 | ENST00000433581 | 458 nt | TSL 3 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | GNG2-205 | ENST00000554736 | 569 nt | APPRIS P1 TSL 4 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC026462.2-201 | ENST00000565771 | 286 nt | TSL 2 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC010653.1-201 | ENST00000571108 | 881 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC090772.1-201 | ENST00000583782 | 507 nt | TSL 5 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC069431.2-201 | ENST00000604149 | 1099 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | TFG-209 | ENST00000615993 | 1244 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AL596245.1-201 | ENST00000618994 | 362 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | VPS13C-203 | ENST00000395896 | 14579 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC008669.1-201 | ENST00000565823 | 2178 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | IGSF11-AS1-201 | ENST00000477009 | 1604 nt | TSL 2 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC007656.2-201 | ENST00000624902 | 4547 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC012321.1-201 | ENST00000561622 | 1588 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | OR9G4-203 | ENST00000641581 | 2603 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | KRTAP15-1-201 | ENST00000334067 | 671 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RNU5A-1-201 | ENST00000362698 | 116 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RNU6-198P-201 | ENST00000384258 | 104 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MIR122-201 | ENST00000385044 | 85 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RSL24D1P1-201 | ENST00000404972 | 493 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | SETP8-201 | ENST00000435341 | 628 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | SNORA70.19-201 | ENST00000516717 | 90 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC013509.1-201 | ENST00000524269 | 339 nt | TSL 3 BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC026333.2-201 | ENST00000542164 | 106 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC011602.1-201 | ENST00000546484 | 331 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MIR6130-201 | ENST00000619419 | 109 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC002064.3-201 | ENST00000623448 | 346 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC068880.5-201 | ENST00000624331 | 290 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | LINC01090-203 | ENST00000632331 | 466 nt | TSL 5 BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC110079.1-202 | ENST00000635213 | 138 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AP005901.5-201 | ENST00000545779 | 1796 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | KIAA0586-215 | ENST00000619722 | 5597 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | ERBIN-201 | ENST00000284037 | 8647 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MT-ND5-201 | ENST00000361567 | 1812 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | KNTC1-204 | ENST00000436959 | 2412 nt | TSL 2 BASIC | 3.46 | □□□□□ -1.85 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MTND5P7-201 | ENST00000413558 | 1798 nt | BASIC | 3.46 | □□□□□ -1.86 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | LTN1-207 | ENST00000614971 | 7756 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.46 | □□□□□ -1.86 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RNU1-75P-201 | ENST00000347264 | 129 nt | BASIC | 3.46 | □□□□□ -1.86 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | LGI1-201 | ENST00000371413 | 1247 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.46 | □□□□□ -1.86 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | DFNB59-201 | ENST00000375129 | 1202 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.46 | □□□□□ -1.86 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RNU6-301P-201 | ENST00000384277 | 107 nt | BASIC | 3.46 | □□□□□ -1.86 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | UBE2V1P2-201 | ENST00000397758 | 440 nt | BASIC | 3.46 | □□□□□ -1.86 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RN7SKP111-201 | ENST00000410349 | 271 nt | BASIC | 3.46 | □□□□□ -1.86 | | |