Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRC47Q8N1G4 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms