Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SOGA3Q5TF21 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SOGA3Q5TF21 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SOGA3Q5TF21 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SOGA3Q5TF21 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SOGA3Q5TF21 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SOGA3Q5TF21 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
SOGA3Q5TF21 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
SOGA3Q5TF21 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SOGA3Q5TF21 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124 ms