Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms