Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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SGCAQ16586 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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SGCAQ16586 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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SGCAQ16586 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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SGCAQ16586 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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SGCAQ16586 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SGCAQ16586 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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