Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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